在讨论单位是否有权利扣除医师证的问题时，我们需要从法律角度和实际情况出发进行分析，根据《中华人民共和国劳动法》第三条，劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利、休息休假的权利、获得劳动安全卫生保护的权利以及接受职业技能培训的权利，第四条明确指出用人单位有权依法制定规章制度，并应当保障劳动者享有劳动权利及履行劳动义务。
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三条的规定，订立劳动合同应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则，第四十七条则规定了经济补偿的计算方式，即按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
在实际操作中，如果单位要求员工提供医师证作为工作条件之一，这可能会引发劳动争议，因为按照法律规定，用人单位不能无故扣留员工的证件或证书，如果单位坚持要求员工出示医师证，并且该证件与工作职责无关，那么这种做法可能违反了劳动法的规定。
如果单位要求员工出示医师证是因为该证件是完成特定工作所必需的，那么这种情况需要具体分析，如果医生的工作涉及到特定的医疗操作或治疗过程，那么单位可能需要相关的执业资格证书来确保其专业性和安全性，在这种情况下，单位可以要求员工出示医师证，但前提是该证件与工作职责直接相关。
单位是否有权利扣除医师证取决于多种因素，包括证件的性质、工作职责以及法律规定，在任何情况下，用人单位都应遵守劳动法的规定，尊重员工的权益，不得无故扣留员工的证件或证书，如果单位要求出示医师证，应确保该证件与工作职责有直接关联。
